Se foi afectado por um vírus e o vírus não lhe permite instalar ou correr o anti vírus pode usar um CD de arranque que tenha o antivírus.
Existem alguns Cd´s que são disponibilizados que permitem fazer isso mesmo.
Por exemplo, em http://www.hiren.info/pages/bootcd pode descarregar e gravar esse CD. De preferência faça isso noutro computador.
Depois basta arrancar o computador a partir do CD e correr os programas de anti-vírus para remover muitos dos vírus mais comuns.
Para utilizadores privados existem vários programas gratuitos de anti-virus como sejam o Avast ou o AVG.